Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lire1P11260 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lire1P11260 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lire1P11260 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lire1P11260 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms