Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prf1P10820 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms