Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P10404 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P10404 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P10404 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
P10404 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms