Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Myod1P10085 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Myod1P10085 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms