Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms