Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calm3P0DP28 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calm3P0DP28 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms