Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pde6gP09174 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pde6gP09174 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pde6gP09174 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pde6gP09174 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Pde6gP09174 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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