Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spta1P08032 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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