Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
TtrP07309 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TtrP07309 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TtrP07309 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TtrP07309 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TtrP07309 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
TtrP07309 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TtrP07309 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TtrP07309 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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TtrP07309 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TtrP07309 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TtrP07309 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TtrP07309 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TtrP07309 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TtrP07309 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TtrP07309 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TtrP07309 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms