Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P06336 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P06336 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P06336 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P06336 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P06336 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P06336 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P06336 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P06336 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P06336 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P06336 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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