Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04213 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04213 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04213 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04213 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04213 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04213 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04213 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04213 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04213 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04213 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P04213 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms