Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P04212 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04212 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04212 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04212 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P04212 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P04212 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P04212 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P04212 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P04212 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms