Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tgfb1P04202 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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