Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms