Protein–RNA interactions for Protein: P01807

Ig heavy chain V region X44, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01807 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01807 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01807 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01807 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01807 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01807 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01807 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01807 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01807 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01807 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01807 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms