Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01657 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01657 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01657 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01657 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ 0
P01657 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01657 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01657 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01657 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01657 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01657 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms