Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01641 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01641 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01641 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01641 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01641 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01641 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01641 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01641 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01641 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01641 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01641 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01641 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01641 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms