Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tcn2O88968 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms