Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd160O88875 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd160O88875 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms