Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hcn2O88703 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms