Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BlmO88700 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BlmO88700 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BlmO88700 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BlmO88700 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BlmO88700 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BlmO88700 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BlmO88700 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BlmO88700 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BlmO88700 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms