Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3bO88509 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3bO88509 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms