Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Kcnk4O88454 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Kcnk4O88454 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Kcnk4O88454 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnk4O88454 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms