Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Tnnt1O88346 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnnt1O88346 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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