Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms