Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms