Protein–RNA interactions for Protein: O88199

Chst3, Carbohydrate sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst3O88199 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chst3O88199 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Chst3O88199 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chst3O88199 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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