Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cd46O88174 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms