Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtssO70370 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtssO70370 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtssO70370 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtssO70370 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtssO70370 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtssO70370 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CtssO70370 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms