Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna4O70174 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms