Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cbx4O55187 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms