Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pja1O55176 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms