Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Aff2O55112 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aff2O55112 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms