Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms