Protein–RNA interactions for Protein: O55040

Nmur1, Neuromedin-U receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmur1O55040 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nmur1O55040 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nmur1O55040 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nmur1O55040 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nmur1O55040 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nmur1O55040 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmur1O55040 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmur1O55040 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nmur1O55040 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms