Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms