Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SlkO54988 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SlkO54988 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SlkO54988 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms