Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms