Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sp100O35892 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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