Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf18O35714 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tnfrsf18O35714 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tnfrsf18O35714 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf18O35714 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms