Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phox2bO35690 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms