Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clk3O35492 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clk3O35492 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms