Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2-ObO35424 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms