Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Abcc1O35379 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Abcc1O35379 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms