Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kpna3O35344 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms