Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmd4O35226 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Psmd4O35226 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms