Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smad6O35182 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms