Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Scarb2O35114 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scarb2O35114 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Scarb2O35114 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Scarb2O35114 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarb2O35114 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarb2O35114 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarb2O35114 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarb2O35114 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Scarb2O35114 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarb2O35114 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scarb2O35114 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Scarb2O35114 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Scarb2O35114 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Scarb2O35114 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Scarb2O35114 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scarb2O35114 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms