Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ArxO35085 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ArxO35085 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ArxO35085 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ArxO35085 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArxO35085 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArxO35085 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArxO35085 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArxO35085 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArxO35085 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ArxO35085 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ArxO35085 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ArxO35085 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms