Protein–RNA interactions for Protein: O09173

Hgd, Homogentisate 1,2-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgdO09173 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HgdO09173 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HgdO09173 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HgdO09173 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HgdO09173 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HgdO09173 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HgdO09173 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HgdO09173 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HgdO09173 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HgdO09173 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HgdO09173 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HgdO09173 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HgdO09173 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms